Vse najboljše!

Vsem bralcem želim v novem letu 2016 veliko zdravja in osebnega zadovoljstva, vaš bloger Franc.

Zgodovina mikrobiologije

Simpatičen pregled zgodovine mikrobiologije v nizu korifej, ki so postavljali mejnike stroke in znanosti. Sicer je pa na YouTube kanalu Microbiology RAMU'S še več uporabnih videoposnetkov. 

2. Mikrobiološki večer

SLOVENSKO MIKROBIOLOŠKO DRUŠTVO 
vabi na 
2. MIKROBIOLOŠKI VEČER »Prihodnost mikrobiologije – lokalno in globalno« 
ki bo 02. 12. 2015 s pričetkom ob 18:00 uri v Viteški dvorani Biotehniške fakultete na Rodici  
 

PROGRAM: 
18:00 – 18:15  Pozdravni nagovor predsednika SMD, znan. svet. dr. Matjaž Ocepek

18:15 – 18:45  »Stare« bakterijske zoonoze – nova grožnja? - Vloga mikrobiologa v
veterinarski medicini, viš. znan. sod. dr. Mateja Pate, Veterinarska fakulteta, UL
 
18:50 – 20:00 OKROGLA MIZA: Smeri razvoja mikrobiologije: nove priložnosti in izzivi za
mikrobiologe

20:00  Družabni program 
 
Pogled v prihodnost mikrobiologije bo vsekakor zahteval dodatno diskusijo ob prijetni glasbi, prigrizku in pijači, za kar bo poskrbljeno v družabnem delu večera. 
 
Udeležba je brezplačna!     
 
Vljudno vabljeni!  
 
Znan. svet. dr. Matjaž Ocepek, predsednik SMD 

MiniSimpozij na KI

Kemijski inštitut v Ljubljani vabi na 4. MiniSimpozij "PROTEINSKE PORE, SEKVENCIRANJE IN BIOINFORMATIKA" v svoji Veliki predavalnici 5. novembra 2015 s pričetkom ob 12. uri.

Molov dan

Kemiki danes slavijo t.i. "molov dan (Mole Day)" ko neformalno počastijo Avogadrovo število, na katerem temelji osnovna merska enota množine snovi.   

Mikrobizem teroirja

Lokalni vinogradniški pogoji, Francozi so za to uveljavili pojem "teroir", pomembno (so)določajo vinski karakter. Tehtnih znanstvenih razlag za vlogo posameznih določevalcev pri oblikovanju vinskega fenotipa žal ni posebno veliko. Zdaj pa so raziskovalci v novozelandskem Aucklandu vendarle dodali konkretnejšo potrditev, da lokalna mikrobna sestava kvasovk v fermentaciji sauvignona povzroči določljivo razliko.

Stanje antibiotikov v 2015

Na vprašanja: Kakšno je trenutno stanje v rabi antibiotikov in odpornosti nanje pri človeku in živalih v svetu? V deželah z nizkim in srednjim dohodkom? Kakšni pristopi na nacionalni strani lahko pomagajo državam v borbi proti odpornosti na antibiotike?  dobite odgovore v publikaciji "The State of the World's Antibiotics, 2015", ki jo najdete v prostem dostopu na strani CDDEP.

The State of the World's Antibiotics, 2015

What is the current state of antibiotic use and resistance in humans and animals around the globe? In low- and middle-income countries? What national-level strategies can help countries combat antibiotic resistance? - See more at: http://cddep.org/publications/state_worlds_antibiotics_2015#sthash.5H0jyT1E.dpuf

What is the current state of antibiotic use and resistance in humans and animals around the globe? In low- and middle-income countries? What national-level strategies can help countries combat antibiotic resistance? - See more at: http://cddep.org/publications/state_worlds_antibiotics_2015#sthash.5H0jyT1E.dpuf

What is the current state of antibiotic use and resistance in humans and animals around the globe? In low- and middle-income countries? What national-level strategies can help countries combat antibiotic resistance? - See more at: http://cddep.org/publications/state_worlds_antibiotics_2015#sthash.5H0jyT1E.dpuf

What is the current state of antibiotic use and resistance in humans and animals around the globe? In low- and middle-income countries? What national-level strategies can help countries combat antibiotic resistance? - See more at: http://cddep.org/publications/state_worlds_antibiotics_2015#sthash.5H0jyT1E.dpuf

What is the current state of antibiotic use and resistance in humans and animals around the globe? In low- and middle-income countries? What national-level strategies can help countries combat antibiotic resistance? - See more at: http://cddep.org/publications/state_worlds_antibiotics_2015#sthash.5H0jyT1E.dpuf

What is the current state of antibiotic use and resistance in humans and animals around the globe? In low- and middle-income countries? What national-level strategies can help countries combat antibiotic resistance? - See more at: http://cddep.org/publications/state_worlds_antibiotics_2015#sthash.5H0jyT1E.dpuf

Mikrobni oblak

Vsi, ki z zanimanjem spremljamo raziskovanje človekovega mikrobioma se bomo morali navaditi na novo sintagmo, ki se uveljavlja v tem področju. Govorim o geslu "mikrobni oblak", ki predstavlja mikrobni prispevek posameznika v ozračje bivalnega okolja. Obširneje o tem govorijo raziskovalci s prvim avtorjem J. F. Meadowom v prispevku "Humans differ in their personal microbial cloud", ki je tudi prostodostopen v PeerJ bazi. Avtorji opozorijo na različne vidike pomena raziskav mikrobnega oblaka, tako v epidemiološkem, ekološkem kot ne nazadnje forenzičnem kontekstu vnosa mikroorganizmov personalnega mikrobioma v okolje. V odličnem podkastu o tej tem spregovorijo tudi J. Meadow, J. Eisen in N. Stockton.  

Odprto drevo življenja

Preko vikenda se je na spletu pojavil  prvi osnutek digitalnega  “drevesa  življenja” v katerem raziskovalci predstavljajo, kaj vemo o pribl. 2,3 milj. poimenovanih organizemskih vrstah in kako so te med seboj povezane. Projekt je poskus uveljavitve koncepta odprte znanosti, saj so k sodelovanju povabljeni vsi, ki razpolagajo s podatki o novoodkritih organizmih. Razen tega pa seveda s svojo prosto spletno dostopnostjo promovira odprti dostop do, za številne vede, pomembnih podatkov. Podrobnosti o nastajanju in izvedbi projekta najdemo tudi na lastnem blogu.

Dolgoživost spor B. anthracis

Ob zadnjem primeru pojava antraksa pri govedu pri nas sem skušal malo ponoviti svoje vedenje od dolgoživosti spor B. anthracis v naravnem okolju. Ubral sem preprostejšo, čeprav seveda manj zanesljivo pot in sem pobaral kar "strička Googla". Kar prvi zadetek mi je ponudil še dodatno zanimivost. Poleg zelo dolgega vztrajanja spor v tleh je epidemiološko morda pomembno, da se bakterija tudi namožujejo v tleh s pomočjo izkoriščanja drugih talnih organizmov, kar so eksperimentalno lahko potrdili za pražival Acanthamoeba castellanii. Kar zadeva dolgoživost spor B.a. navaja Wikipedia preko 70 let, najdemo pa tudi navedke o vztrajanju v tleh za dobo 300 let. Občasne najdbe spor bakterij iz rodu Bacillus v nekaj milijonov let starih fosilnih ostankih, ki jih je bilo mogoče znova aktivirati, pa ostajajo vprašljive zaradi težav pri nadzoru eksperimentalnega postopka. 

Mikrobiološki članki v OD na PeerJ

Na spletni arhivski strani PeerJ so v odprtodostopni obliki na voljo članki vodilnih avtorjev v mikrobiologiji. Novejše predstavitev najdete >tukaj.

Koristna iniciativa

Obeta se nam rešitev za težavo, ki zadnja leta močno ovira razvoj vitalnih zdravil, zlasti vakcin. Trije raziskovalci, kot poroča Business Insider, predlagajo oblikovanje projektne fondacije, ki bi razvijalcem omogočila pospešitev preverjanja učinkovitosti in tako uvajanja novih vakcin.

Obetavna vakcina

Mediji so v preteklih dneh obsežno obveščali javnost ( >tukaj, >tukaj ), da je poskusna vakcina proti Eboli, ki so jo v zadnjih mesecih preskušali na ogroženih območjih vzhodne Afrike, pokazala izjemno učinkovitost. Podrobnosti o tem, kako je projekt razvoja te vakcine tekel skozi zadnja leta nam predstavlja dr. Racaniello na svojem blogu. In istočasno z razgrnitvijo dolgotrajnih naporov tega projekta tudi najbolje zavrne pogoste očitke in začudenje, da že prej ni bilo na voljo ustrezne zaščite.    

"Kvote" za kongresne odbore

V zadnji številki e-revije Inside Higher Ed mi je pozornost zbudil prispevek Scotta Jaschika "Ending All-Male Panels" predvsem zato, ker je svojo tezo obdelal na primeru Ameriškega mikrobiološkega društva (ASM). Tema, ki se je je Jaschik lotil, je nediskriminatorno vključevanje žensk v organizacijo kongresnih prireditev, še zlasti ko gre za panelne odbore. ASM je namreč v zadnjih letih doseglo izjemne uspehe pri uravnoteževanju ženske prisotnosti. Število ženskih predavateljev na njihovih zelo odmevnih letnih kongresih je od leta 2011 do letos narastlo od 26,7% na 48,5% in število panelnih odborov, kjer so prevladovali moški je padlo od 35,7% na 4,1% v istem obdobju, kot je mogoče prebrati v študiji A. Cassadevalla in sod., ki jo citira Jaschik. V citiranem članku so zanimive tudi druge ugotovitve, npr. ta: "Med člani ASM danes ženske predstavljajo večino med študenti in podoktorandi tako da to predstavljajo prihodnost društva". In nadaljuje: "Torej je pomembno posredovati to sporočilo v naslednjo generacijo, da v tem področju ni diskrimintorne meje, kar zadeva spol.". Samo želimo si lahko, da je mogoče tak trend pričakovati tudi v našem okolju. 

Mikrobiologija - konference

Poglejmo, katere konference, pomembne za mikrobiologe, nas še čakajo v tem letu.

Aktualno o MERSu

Aktualne podatke o gibanju okužb z virusom bližnjevzhodnega respiratornega sindroma - MERS (Middle East Respiratory Syndrome) v vzhodni Aziji  prinaša blog H5N1, kjer lahko najdete tudi sprotne podatke o gibanju Ebole v zahodni Afriki.

Mikrobiološka poletna šola GSO

Društvo študentov mikrobiologije Slovenije (DŠMBS) objavlja organizacijo "Mikrobiološke poletne šole GSO" v septembru 2015.

Predavanje na MF

Prof. dr. P. Veranič iz IBC MF sporoča:

V okviru bilateralnega projekta z ZDA prihaja na obisk prof. dr. Matthew Mulvey (Division of Microbiology and Immunology, University of Utah). Prof Mulvey je eden od vodilnih strokovnjakov  na področju bakterijskega cistitisa. Predavanje z naslovom »Sepsis, Urinary Tract Infections, and the Maniacal Plans of Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli for World Domination« bo imel v ponedeljek 15.6.2015 ob 11h  v predavalnici Inštituta za fiziologijo, Medicinska fakulteta, Zaloška 4.  

Predavanje na NiBu

Nacionalni inštitut za biologijo Vas vabi, da se udeležite predavanja: 

« Some aspects of the taxonomy and control of Pseudomonas syringae pv actinidiae (Psa) the causal agent of bacterial canker of kiwifruit »

 

ki ga bo predstavil dr. Joel L. Vanneste

iz novozelandskega inštituta Plant & Food Research Ltd

 

Predavanje bo potekalo v četrtek 18. junija 2015, ob 13:00 uri, v Biološkem središču, Večna pot 111, v Ljubljani, v predavalnici B3.

Preplah v laboratorijih

Zadnje dneve odmeva v ZDA nenavaden spodrsljaj. Iz vojaškega laboratorija Dugway Proving Ground v državi Utah so bili s FedEx pošto razposlani biološki vzorci, ki so vsebovali žive bakterije Bacillus anthracis, na več naslovov državnih in privatnih laboratorijev. No, zadeva k sreči ne kaže, da bi bila del zarote, saj gre za testne vzorce v projektu preverjanja bioloških groženj v okolju. Material naj bi vseboval mrtve klice, kaže pa, da postopek uničenja žive kužnine ni bil učinkovit. Novejši podatki kažejo, da so bili sporni vzorci razposlani v 51 laboratorijev v ZDA in v tri, predvsem ameriške vojaške laboratorije, v tujini. Ameriško ministrstvo za obrambo (DoD) zagotavlja, da v nobenem primeru ni bilo ogroženo javno zdravje, le preventivno so 31 ljudi, ki so prišli v stik s pošiljkami, zaščitili z antibiotiki.