21 december, 2014

Epidemiološko kartiranje

Skupina Spatial Ecology and Epidemiology Group na Department of Zoology Univerze v Oxfordu (Vel. Britanija) se ukvarja s projekti kartiranja nekaterih infektivnih bolezni in njihovih vektorjev. Podatke objavljajo odprtodostopno preko spletnega portala GitHub. Pri tem zajemajo podatke iz različnih bibliografskih virov (npr. PubMed), vključujejo podatke iz sodelav ali pa iz sorodnih internetnih virov zdravstvenega nadzora kot je npr. HealthMap oz. kot je primer nadzora lokacije bolezenskega vektorja v Malaria Atlas Project.

05 december, 2014

Knjiga, ki navdušuje

Konec leta je tudi priložnost, ko se marsikje poklonijo popularnim in uglednim sodržavljanom. Nemci to počno npr. s prireditvijo Menschen 2014 – Ljudje 2014 (ki pravkar teče na programu ZDF). Med letošnje Nemke/Nemce 2014  se je uvrstila tudi mladenka Giulia Enders. Mesto si je zaslužila  kot avtorica letos najbolje prodajane knjige na nemškem trgu. Prodanih je bilo 800.000 izvodov knjige z naslovom Darm mit Charme – Črevo s šarmom. Giulia je nadebudna študentka medicine, ki jo je med medicinskimi temami prevzelo dogajanje v naših prebavilih. Z delom je pravzprav postavila prijazen spomenik sožitju človeka z njegovo mikrobno združbo v prebavnem traktu. Delo odlikujeta zelo popularna pripoved, ki jo učinkovito dopolnjujejo simpatične risane ilustracije. Kot nalašč (in seveda ne gre za slučaj) je trenutno preučevanje človekove mikrobne združbe, t.i. projekt mikrobiom (Human Microbiome Project) med najbolj vročimi raziskovalnimi temami v naravoslovju.  

23 november, 2014

Mikrobiom v blogu

Zdaj že tretje leto lahko spremljamo vesti o prebavnem mikrobnem okolju na blogu Gut Microbiota Worldwatch. Spletno stran pripravljajo pri European Society of Neurogastroenterology and Motility (ESNM) in je namenjena objavljanju aktualnih vesti o prebavnem mikrobiomu za najširšo javnosti ter medije. Od nedavna je stran na voljo v treh jezikih, poleg angleščine tudi v francoščini in španščini.  ESNM sicer pripravlja tudi spletišče Gut Microbiota for Health, ki pa je namenjeno strokovni javnosti za strokovne razprave na temo prebavne mikrobne združbe. 

20 november, 2014

Vabilo na strokovno srečanje BioBosh

Prenašam vabilo:

Vabljeni na dogodek BioBash, ki se bo odvil 4. decembra 2014 ob 18h v prostorih Fakultete za računalništvo in informatiko na Večni poti 113 v Ljubljani.

Namen BioBash dogodkov je medsebojno povezovanje strokovnjakov s področij ved o življenju, bioinformatikov, matematikov, računalničarjev ter vseh, ki jih zanima obdelava bioloških podatkov. S tovrstnimi srečanji želimo spodbujati diskusijo in izmenjavo znanj na področju bioinformatike – hitro razvijajoče se vede, ki zahteva močno interdisciplinarno sodelovanje.

Osrednja tema dogodka bo “Uporabniška izkušnja v bioinformatiki / User Experience in Bioinformatics”. Kakšna bioinformatična orodja so danes na voljo raziskovalcem? Zakaj je nekatera lažje uporabljati od drugih? Zakaj nekateri bioinformatiki pri svojem delu raje uporabo ukazne vrstico od grafičnih vmesnikov? Je učenje dela z ukazno vrstico res tako težavno? Odgovore na takšna in podobna vprašanja bomo skupaj iskali tekom dogodka. Prisluhnili boste lahko trem predavateljem, sodelovali na interaktivnem kvizu in prisluhnili debati na okrogli mizi. Srečanje bomo sklenili z neformalnim druženjem.

Na predavateljski oder bodo stopili:
prof. dr. Blaž Zupan – vodja Laboratorija za bioinformatiko na Fakulteti za računalništvo in informatiko UL,
Alenka Šmid – raziskovalka na Fakulteti za farmacijo UL,
dr. Sabina Berne in Kristina Marton – raziskovalki na Biotehniški fakulteti UL.

Vse novice v povezavi z dogodkom bomo objavili na FB strani
http://goo.gl/dzPNaC
Dogodek je brezplačen, a vas zaradi boljše organizacije vljudno naprošamo, da svojo udeležbo potrdite prek portala Eventbrite na naslovu  http://goo.gl/3Gcaj4

Prijazen pozdrav
Ekipa Genialis

Predavanje

Prenašam vabilo na predavanje:

V organizaciji Mednarodnega zdravstvenega foruma ZF UL bo potekalo dne 26.11.2014 ob 11.00 uri v predavalnici 118 Zdravstvene fakultete vabljeno predavanje z naslovom:
When bacteria adhere to a surface there is more to it than counting numbers
Predaval bo prof. dr. Henk J. Busscher, University Medical Centre Groningen, Groningen, Netherlands
Predavanje bo v potekalo v angleškem jeziku. Vabilo najdete tukaj.

Vljudno vabljeni!

Prof. dr. Polonca Trebše, l.r.
Prodekanja za kakovost in mednarodno sodelovanje

15 november, 2014

Odkod poimenovanja genov

Ali ste se že kdaj vprašali kako dobijo geni svoja imena, kratke veččrkovne oznake? Odkod so imena kot MAPK1 ali EGFR. Kratek prispevek v NY Timesu pojasni skrivnost kovanja the oznak. 

12 november, 2014

Predavanje SMD

Vljudno vabljeni na predavanje “Natural variation in the social soil bacterium Myxococcus xanthus”. Predaval bo dr. Michiel Vos, v četrtek, 13. 11. 2014 ob 10:00h v predavalnici B1, Biološko središče, Večna pot 111, Biotehniška fakulteta, UL.

03 november, 2014

Definicija prokarionta

Morda je res čas, da se znova zamislimo nad ustreznostjo definicije “prokarionta”. O tem smiselno razpravlja N. Nanninga v Schaechterjevem blogu.

22 oktober, 2014

Predavanje Bitka z mikrobi

Znanost na cesti vabi na predavanje prof. dr. Davida Stoparja Bitka z mikrobi.

ZnC_web_Bitka z mikrobi(1)

05 oktober, 2014

Sproti o eboli

Zelo aktualno poroča o eboli v posebnem spletnem časniku Ebola Virus Outbreak agencija NBC News.

26 september, 2014

Zdravilne učinkovine povezane z mikrobiomom

Skupina raziskovalcev pod vodstvom Michaela Fischbacha iz kalifornijske univerze v San Franciscu odkriva biosintetske produkte bakterij človeškega mikrobioma z antibiotskim učinkom. Bakterijski izločki mikrobioma bi morda v prihodnje lahko služili tudi kot zdravilne učinkovine za različne druge namene (kot nevrotransmiterji, imunski regulatorji…), kot je Fischbach povedal v pogovoru za revijo Economist.

16 september, 2014

Pomoč ameriške vojske v katastrofi z Ebolo v Z. Afriki

Vznemiri me vsaka napoved uporabe vojaške sile pri urejanju česarkoli, vendar me tokratna napoved angažiranja ameriških vojakov v borbi proti Eboli navdaja z globoko simpatijo. Prepričan sem, da je bistveni cilj posega urejanje kaotičnih razmer v prizadetem področju, kjer so lokalni oblastni dejavniki popolnoma izgubili nadzor nad širjenjem te strahotne bolezni. Ker spremlja akcijo tudi zajetna finančna pomoč, pridobiva dogajanje po daljšem času bolj optimističen videz. Napovedi npr. evropske agencije ECDC so bile namreč izrazito črnoglede in samo upati je mogoče, da bodo odločni in koncertirani posegi v organizacijo in infrastrukturo zdravstveno humanitarne kampanje zagotovili čimprejšnji ugoden preobrat.   

13 september, 2014

O eboli v Science

Tudi v revijalni hiši Science so se odločili, da bodo novice in znanstvene prispevke, ki obdelujejo problematiko ebole sprostili v prost dostop na posebni spletni strani

07 september, 2014

Ebola raziskave na Flipboardu

OA založba PLoS se je odločila, da bo ponudila vse prispevke iz svojega korpusa objav na temo Ebole v posebni izdaji Flipboarda z imenom PLOS Ebola Collection. S to potezo želi izboljšati pretok informacij o tej aktualni in akutni zdravstveni grožnji, ki pretresa svet. Podoben namen ima tudi njihova promocija posebne novičarske strani za hitro obveščanje PLOS Currents Outbreaks.

30 avgust, 2014

O mlečnokislinskih bakterijah

O lastnostih mlečnokislinskih bakterij, o njihovem pomenu v mikrobiomu gostiteljev in o njihovi uporabi v klasičnih biotehnoloških rešitvah si lahko preberete v 12 prispevkih, ki so s povezavami dosegljivi v BioMed Central blogu.