Mikrobiom v blogu

Zdaj že tretje leto lahko spremljamo vesti o prebavnem mikrobnem okolju na blogu Gut Microbiota Worldwatch. Spletno stran pripravljajo pri European Society of Neurogastroenterology and Motility (ESNM) in je namenjena objavljanju aktualnih vesti o prebavnem mikrobiomu za najširšo javnosti ter medije. Od nedavna je stran na voljo v treh jezikih, poleg angleščine tudi v francoščini in španščini.  ESNM sicer pripravlja tudi spletišče Gut Microbiota for Health, ki pa je namenjeno strokovni javnosti za strokovne razprave na temo prebavne mikrobne združbe. 

Vabilo na strokovno srečanje BioBosh

Prenašam vabilo:

Vabljeni na dogodek BioBash, ki se bo odvil 4. decembra 2014 ob 18h v prostorih Fakultete za računalništvo in informatiko na Večni poti 113 v Ljubljani.

Namen BioBash dogodkov je medsebojno povezovanje strokovnjakov s področij ved o življenju, bioinformatikov, matematikov, računalničarjev ter vseh, ki jih zanima obdelava bioloških podatkov. S tovrstnimi srečanji želimo spodbujati diskusijo in izmenjavo znanj na področju bioinformatike – hitro razvijajoče se vede, ki zahteva močno interdisciplinarno sodelovanje.

Osrednja tema dogodka bo “Uporabniška izkušnja v bioinformatiki / User Experience in Bioinformatics”. Kakšna bioinformatična orodja so danes na voljo raziskovalcem? Zakaj je nekatera lažje uporabljati od drugih? Zakaj nekateri bioinformatiki pri svojem delu raje uporabo ukazne vrstico od grafičnih vmesnikov? Je učenje dela z ukazno vrstico res tako težavno? Odgovore na takšna in podobna vprašanja bomo skupaj iskali tekom dogodka. Prisluhnili boste lahko trem predavateljem, sodelovali na interaktivnem kvizu in prisluhnili debati na okrogli mizi. Srečanje bomo sklenili z neformalnim druženjem.

Na predavateljski oder bodo stopili:
prof. dr. Blaž Zupan – vodja Laboratorija za bioinformatiko na Fakulteti za računalništvo in informatiko UL,
Alenka Šmid – raziskovalka na Fakulteti za farmacijo UL,
dr. Sabina Berne in Kristina Marton – raziskovalki na Biotehniški fakulteti UL.

Vse novice v povezavi z dogodkom bomo objavili na FB strani
http://goo.gl/dzPNaC
Dogodek je brezplačen, a vas zaradi boljše organizacije vljudno naprošamo, da svojo udeležbo potrdite prek portala Eventbrite na naslovu  http://goo.gl/3Gcaj4

Prijazen pozdrav
Ekipa Genialis

Predavanje

Prenašam vabilo na predavanje:

V organizaciji Mednarodnega zdravstvenega foruma ZF UL bo potekalo dne 26.11.2014 ob 11.00 uri v predavalnici 118 Zdravstvene fakultete vabljeno predavanje z naslovom:
When bacteria adhere to a surface there is more to it than counting numbers
Predaval bo prof. dr. Henk J. Busscher, University Medical Centre Groningen, Groningen, Netherlands
Predavanje bo v potekalo v angleškem jeziku. Vabilo najdete tukaj.

Vljudno vabljeni!

Prof. dr. Polonca Trebše, l.r.
Prodekanja za kakovost in mednarodno sodelovanje

Odkod poimenovanja genov

Ali ste se že kdaj vprašali kako dobijo geni svoja imena, kratke veččrkovne oznake? Odkod so imena kot MAPK1 ali EGFR. Kratek prispevek v NY Timesu pojasni skrivnost kovanja the oznak. 

Predavanje SMD

Vljudno vabljeni na predavanje “Natural variation in the social soil bacterium Myxococcus xanthus”. Predaval bo dr. Michiel Vos, v četrtek, 13. 11. 2014 ob 10:00h v predavalnici B1, Biološko središče, Večna pot 111, Biotehniška fakulteta, UL.

Definicija prokarionta

Morda je res čas, da se znova zamislimo nad ustreznostjo definicije “prokarionta”. O tem smiselno razpravlja N. Nanninga v Schaechterjevem blogu.

Predavanje Bitka z mikrobi

Znanost na cesti vabi na predavanje prof. dr. Davida Stoparja Bitka z mikrobi.

Sproti o eboli

Zelo aktualno poroča o eboli v posebnem spletnem časniku Ebola Virus Outbreak agencija NBC News.

Zdravilne učinkovine povezane z mikrobiomom

Skupina raziskovalcev pod vodstvom Michaela Fischbacha iz kalifornijske univerze v San Franciscu odkriva biosintetske produkte bakterij človeškega mikrobioma z antibiotskim učinkom. Bakterijski izločki mikrobioma bi morda v prihodnje lahko služili tudi kot zdravilne učinkovine za različne druge namene (kot nevrotransmiterji, imunski regulatorji…), kot je Fischbach povedal v pogovoru za revijo Economist.

Pomoč ameriške vojske v katastrofi z Ebolo v Z. Afriki

Vznemiri me vsaka napoved uporabe vojaške sile pri urejanju česarkoli, vendar me tokratna napoved angažiranja ameriških vojakov v borbi proti Eboli navdaja z globoko simpatijo. Prepričan sem, da je bistveni cilj posega urejanje kaotičnih razmer v prizadetem področju, kjer so lokalni oblastni dejavniki popolnoma izgubili nadzor nad širjenjem te strahotne bolezni. Ker spremlja akcijo tudi zajetna finančna pomoč, pridobiva dogajanje po daljšem času bolj optimističen videz. Napovedi npr. evropske agencije ECDC so bile namreč izrazito črnoglede in samo upati je mogoče, da bodo odločni in koncertirani posegi v organizacijo in infrastrukturo zdravstveno humanitarne kampanje zagotovili čimprejšnji ugoden preobrat.   

O eboli v Science

Tudi v revijalni hiši Science so se odločili, da bodo novice in znanstvene prispevke, ki obdelujejo problematiko ebole sprostili v prost dostop na posebni spletni strani. 

Ebola raziskave na Flipboardu

OA založba PLoS se je odločila, da bo ponudila vse prispevke iz svojega korpusa objav na temo Ebole v posebni izdaji Flipboarda z imenom PLOS Ebola Collection. S to potezo želi izboljšati pretok informacij o tej aktualni in akutni zdravstveni grožnji, ki pretresa svet. Podoben namen ima tudi njihova promocija posebne novičarske strani za hitro obveščanje PLOS Currents Outbreaks.

O mlečnokislinskih bakterijah

O lastnostih mlečnokislinskih bakterij, o njihovem pomenu v mikrobiomu gostiteljev in o njihovi uporabi v klasičnih biotehnoloških rešitvah si lahko preberete v 12 prispevkih, ki so s povezavami dosegljivi v BioMed Central blogu.   

Mikrobiologija v družbenih medijih

Splet Webicine nam je pripravil zelo uporaben zbir spletnih vsebin za mikrobiologijo v družbenih medijih: novic, blogov, podkastov, forumov, twiterjev, wikijev, video portalov, mobilnih aplikacij, iskalnikov, predstavitvenih aplikacij in drugih virov.

Je Ebola tudi v DR Kongo

V današnjih zapisih na blogu H5N1 se kopičijo podatki o izbruhu nalezljivega obolenja s številnimi smrtnimi izidi v Demokratični republiki Kongo. Na voljo naj bi bili tudi že prvi pozitivni izvidi, da je posredi virus Ebole. Izvor naj bi ne bil vezan na prenos iz Zap. Afrike, ampak naj bi se ljudje okužili lokalno z zaužitjem opičjega mesa (t.i. bush meat).  

Mikrobiom in obnašanje

Avtor C. Zimmer nam v prispodobi pripiše vlogo marionete, ki jo upravljajo mikroorganizmi našega mikrobioma. Sodobne molekularne tehnike prepoznavanja mikrobne identitete so omogočile intenzivno preučevanje mikrobnih združb, tistih, ki naseljujejo naše navzven odprte organe ter tistih, ki jih nosimo na površini telesa. Ugotovitve zadnjega desetletja, ki se kopičijo s skoraj modno ihtavostji so pripeljale do presenetljivih ugotovitev. Tako v pomembnih nalogah sodelovanja mikroorganizmov pri prebavi, pri zagotavljanju učinkovitih obrambnih mehanizmov proti patogenim organizmov pa vse do najbolj presenetljivih podmen o vplivu mikroorganizmov mikrobioma na obnašanje gostitelja tako v odzivih na okoljske vplive in z vplivom na njegove prehranske navade. Raziskave  na poskusnih živalih kažejo, da je mogoče z mikroorganizmi razložiti celo vplive na socialno sobivanje. To brez dvoma pomeni bistvene prednosti za gostitelja, prav tako pa tudi za njegovo mikrobno združbo. Raziskovalci se radi poigravajo z načrti, da če mikroorganizmi manipulirajo nas, potem moramo najti poti, da bomo zmogli tudi mi manipulirati njih.   

Listerija na Danskem

Na Danskem pa tudi drugod po Evropi je precej zaskrbljenosti povzročila vest o okužbah z listerijo (bakterija Listeria monocytogenes), ki naj bi svoj izvor imele v klobasah iz prašičjega mesa in naj bi v zadnjem letu zahtevale že 12 življenj. Nekaj osnovnih informacij o povzročitelju in bolezni si lahko preberete tukaj, kjer je sicer zgodba vezana na primere listerioze v ZDA, povezane z zauživanjem koščičastega sadja. 

Odličen intervju v Dnevniku o eboli

V današnjem Dnevniku najdete odličen intervju s prof. dr. Tatjano Avšič-Županc o eboli in naši pripravljenosti na ev. nevarnost vnosa te bolezni (bojim se, da članek na spletu ni odprtodostopen, uporabniki Piana pa ga lahko preberejo).

Sicer pa lahko prisluhnete izčrpnejšemu pogovoru o eboli v oddaji na Intelekti

Aktualne vesti o Eboli.

Trenutno je blog H5N1 spletna stran, ki najizčrpneje in najobširneje poroča o tragičnem dogajanju v zahodni Afriki, kjer skušajo omejiti širjenje mrzlice Ebola.  Po podatkih WHO je do 1. avgusta umrlo že 887 od skupno 1.603 obolelih.

Zdaj se pojavljajo tudi že prva poročila o eksperimentalni možnosti seroterapije Ebole, ki je kot kaže bilo uporabljena tudi pri obeh obolelih, ki ju zdravijo na ameriških tleh.

PS.: NBC News objavlja v posebni prilogi Ebola virus outbreak tekoče novice o dogajanju.  

Prevoz bolnikov z Ebolo v ZDA

Mikrobiologe, zlasti še medicinske mikrobiologe in tudi epidemiologe trenutno najbolj zaposluje izbruh vročice Ebola v državah zahodne Afrike. Zaradi možnosti intenzivnejšega zdravljenja so se ameriške zdravstvene oblasti odločile, da ta trenutek dva pacienta pod posebno strogim režimom prevoza in nato oskrbe iz Liberije prepeljejo v ZDA v univerzitetno klinično bolnišnico Emory. Vrhunske strokovne kapacitete v ZDA zagotavljajo, da je rešitev povsem brez nevarnosti za prebivalstvo, saj gre za preverjen scenarij ravnanja z boleznimi najvišje stopnje rizika.

PS.: gotovo si želite več podatkov o tej bolezni; splošno vedenje ponuja ta zapis, o trenutnem stanju pa poroča CNN.