Vakcina proti listerijam

So mikrobi, ki se znajo odlično zavarovati pred imunsko obrambo gostitelja, skrijejo se namreč v notranjost njegovih celic. Kako so se lotili razvoja vakcine proti takšnim skrivačem kot je npr. Listeria monocytogenes, nam sporočajo iz Harvard Medical School.

Svetovni dan vode

Ne pozabimo: 22. marec je svetovni dan vode - najdragocenejšega življenjskega resursa - glej >tukaj, >tukaj in >tukaj.

E-učbenik

Prof. Timothy Paustian iz Univerze Wisconsin je na svoji spletni strani Microbiology and Bacteriology-The world of microbes, ki je pravzaprav inovativen e-učbenik in mikrobiološki novičarski splet, pravkar objavil dopolnjeno poglavje Microbial cell structure. Moji študenti(ke) bodo brez dvoma lahko tekst koristno uporabili za utrjevanje znanja.    

Helicobacter nekoliko drugače

Na spletu se pojavlja novo, učinkovito orodje, t.i. »mashup« (upajmo, da se bo kmalu našlo primerno slovenska poimenovanje). Primer njegove uporabe, ki bo koristen tudi mikrobiologom je npr. iSpecies. S tem iskalcem smo blizu ideji E. O. Wilsona o spletni strani za vsako biološko vrsto. Iskalni algoritem preiskuje splet in na posebni strani poveže relevantne informacije. Poglejmo kako zgleda npr. spletna stran za Helicobacter pylori.

Škrati na BF

Pohvala gre na Katedro za botaniko Oddelka za biologijo BF, kjer so se kot kaže odločili, da v učni proces vključijo škrate. Vsaj trije škrati so že na delu: Študentov škrat, Zeleni Škrat in Živilski škrat. Upati je, da se bo kmalu škratja družina pomnožila. Hvala tudi sodelavcem našega neumornega in odličnega bloga KeBi03 za opozorilo o razsajanju škratov.

Kot vse kaže se bo vendarle udejanjilo to, česar vodstvo UL z RCU doslej ni uspelo izpeljati, da bi namreč na naši Univerzi uveljavili virtualni pouk. Zdaj se to dogaja s pobudami »od spodaj«. Težava takega pristopa je seveda, da ostajajo rešitve predolgo anonimne, da so nekoordinirane in vodijo v ponavljajoče odkrivanje Amerike.

Uspešna biološka zdravila

Biološka zdravila (iz biotehnološke proizvodnje) zasedajo v celotni svetovni prodaji vse pomembnejši delež. Po ameriških podatkih je prodaja zdravil v letu 2005 porasla za 5.4% v  vrednosti 252 milijard dolarjev, pri čemer pa je rast bioloških zdravil dosegla 17% rast v vrednosti 33 milijard dolarjev. Podrobneje se je o tem razpisala revija Forbes.

K izboljšanju pnevmokoknih vakcin

Pnevmokoki (taksonomsko: Streptococcus pneumoniae) so pogosti povzročitelji neinvazivnih bolezni, kot so ušesne in sinusne infekcije ali pa invazivnih bolezni kot sta pljučnica ali pa meningitis. Slednji povzročata letno do milijona smrti otrok iz dežel v razvoju. Na voljo so vakcine, ki so uperjene proti polisaharidni kapsuli, na kateri temelji tako patogenost tudi serološka spremenljivost bakterije; znanih je 90 različnih serotipov. Na Wellcome Trust Sanger Institute so se lotili preučevanja genetskega ozadja variabilnosti kapsule s ciljem razviti učinkovitejše vakcine.

Umetniški navdih iz mikrobne rasti

Na slikovnem/slikovitem blogu Pruned so nam postregli s čudovitimi posnetki kolonijske mikrobne rasti v Petrijevih posodah. Sicer je pa mogoče še več posnetkov najti na spletni strani izraelskega avtorja, fizika Eshela Ben Jacoba. Pojav nedvomno vzbuja pristne estetske občutke, zaposluje teoretike fraktalne geometrije, v mikrobni rasti pa temelji na zanimivi lastnosti medcelične komunikacije t. i. zaznavanja gostote – quorum sensing (1 in 2).

MRSA se skriva

Kot lahko preberemo v Biology News Net so raziskovalci iz Univerze Bath dokazali, da »superbakterija« MRSA (Staphylococcus aureus rezistenten na meticilin) okužuje in se tudi razmnožuje v amebah Acanthamoeba polyphaga, ki so povsodne v okolju in jih najdemo npr. v vodovodnih odtokih, v  vazah in na stenah. Ta najdba seveda močno komplicira varovanje pred razširjanjem mikroorganizma, ki je tudi hud bolnišnični problem zaradi hospitalnih infekcij.

Izraba odpadnega stiropora

Raziskovalcem iz University College Dublin na Irskem je, kot to lahko preberemo v reviji Scientific American,  uspelo zelo pomembno odkritje, kako biološko razgraditi oz. celo izkoristiti t. i. stiropor (Styrofoam). Kevin O'Connor je s sodelavci pirolitično t.j. s segrevanjem na 520 stopinj C razgradil stiropor v mešanico produktov v kateri je z 80% prevladovalo stirensko olje ob drugih sicer tudi toksičnih spojinah. Zmes so nato uporabili kot gojišče za rast posebnega seva bakterije Psedomonas putida CA-3, ki je ne samo, da je na tem »koktailu« uspela rasti, ampak je ob izkoriščanju stirenskega olja celo proizvajala polihidroksialkanoate (PHA), polimerno snov iz katere je mogoče pridobiti biorazgradljive plastične materiale. Proces sicer še skriva nekatera nerešena vprašanja, zlati v zvezi z fermentacijskimi ostanki, v katerih so tudi toluen in druge za okolje problematične spojine, vendar pa so ti prvi rezultati zelo obetavni.  

Prepoznava mikrobnih vrst

Raziskovalci na U.S. Department of Energy’s Brookhaven National Laboratory so razvili novo učinkovito metodo za prepoznavo različnih mikrobnih vrst v neznanih mikrobnih združbah. Metoda opisana v marčevski številki revije Applied Environmental Microbiology ima številne možnosti uporabe, od določitve mikroorganizmov v okolijskih vzorcih, prepoznave vrst koristnih za čiščenje okolijskega onesnaženja, identifikacije patogenih mikrobov in razlikovanje neškodljivih mikrobov od morebitnih potencialnih mikroorganizmov v bioterorističnem delovanju. Obsežnejši zapis najdete >tukaj.

Nanocevke kot biosenzorji

Ogljikove nanocevke naj bi postale obetaven material za pripravo biosenzorjev. Skupina raziskovalcev na Univerzi Illionois Urbana-Champaign, ki jo vodi prof. Michael Strano preskuša nekatere od rešitev. Kot povzema ScienceDaily poročajo v reviji Science o možnosti, da bi z nanocevkami, prekritimi z DNK, lahko odkrivali specifične molekularne vzorce. Z naslojitvijo enotračne DNK na nanocevke bi pridobili senzor s katerim bi lahko ciljno odkrivali dele komplementarne DNK v celicah ali v okoljskih vzorcih. Po vezavi komplementarne DNK na DNK senzorske nanocevke (pojav hibridizacije), se namreč naravna bližnja infrardeča fluorescenca nanocevk zaznavno spremeni. Podobno rešitev je že pred časom ta skupina predlagala tudi za pripenjanje encimov na nanocevke, ki bi jih nato kot biosenzorje vstavili v tkivo in bi služile npr. za dokazovanje ravni glukoze.

Vitamin D in tuberkuloza

Vitamin D sodeluje v vzpostavljanju ključnega protimikrobnega odziva proti Mycobacterium tuberculosis pri človeku, kot poroča Science in povzema The Scientist. Ugotovitev razloži, zakaj so Afroameričani, ki imajo nižjo raven vitamina D, bolj občutljivi za tuberkulozo.

Zakonitosti epidemij

Čas aviarne influence je naklonjen spraševanju o zakonitosti epidemičnega razširjanja obolenj. Zato ni nepričakovano, da je veliko pozornosti zbudilo nedavno sporočilo nemških raziskovalcev  D. Brockmanna, L. Hufnagela in T. Geisela, ki so uporabili spletno stran, s katero si v Ameriki krajšajo čas radovedneži, ko spremljajo pot svojih dolarskih bankovcev po deželi, za analizo potovalnih navad ljudi na osnovi gibanja denarja v obtoku. Govorim o spletni strani Where's George, kjer lahko vnesete številke svojih dolarskih bankovcev, ki jih dajete v obtok in nato iz sporočil drugih spletnih udeležencev o ponovnem pojavljanju istih številk lahko ugotovite kam je zašel vaš nekdanji bankovec. Seveda je intenzivnost gibanja oz. potovalne navade prebivalstva danes tesno povezana z razširjanjem nalezljivih bolezni.

Aktualno o aviarni influenci

Če želite spremljati trenutno dogajanje o ptičji gripi pri nas, potem velja občasno pogledati nekatere aktualnejše splete doma in na tujem. Najprej seveda skok na splet Urada vlade za informiranje oz. na njegova Sporočila za javnost. Na straneh Ministrstva za zdravje in Ministrstva za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano boste v rubrikah Aktualno ali Novice sproti obveščani o vsem najnovejšem in prav tako v podobni rubriki na straneh Inštituta za varovanje zdravja RS in Veterinarske uprave RS. Trenutno so v Evropski uniji ugotovili ali oznanili sum prisotnosti ptičje gripe v šestih članicah: 11. februarja 2006 v Grčiji, 12. februarja v Italiji in prav tako 12. februarja v Sloveniji, 14. februarja v Avstriji in Nemčiji in 15. februarja 2006 na Madžarskem. Laboratorij v Padovi, ki pa ni evropski referenčni laboratorij, je tako pri pticah iz Italije kot iz Slovenije potrdil prisotnost zloglasnega virusa H5N1. Na spletnih straneh EU lahko novice o ptičji gripi oz. aviarni influenci spremljamo >tukaj, nekoliko obsežnejšo informacijo pa najdemo >tukaj. O prehranski varnosti živil živalskega vira beremo lahko na straneh Food Safety – From the Farm to the Fork s povezavami tudi do aktualnih novic o aviarni influenci. Druge aktualne spletne strani v Evropi so še: The European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), European Food Safety Authority (EFSA) in seveda splet World Health Organization (WHO) oz. njenega Evropskega urada z novicami o aviarni influenci. In tu so še strani European Influenza Surveillance Scheme (EISS), spletna stran EU Direktorata za zdravje z informacijami o gripi in evropska služba EuroGROG pa splet Svetovne organizacije za zdravje živali OIE in spletna stran Oddelka za kmetijstvo pri organizaciji FAO. Seveda pa v nobenem primeru ne gre brez informacij in ekspertize ameriških Centrov za kontrolo in preprečevanje bolezni CDC ter britanske Veterinary Laboratories Agency, kjer v referenčnem laboratoriju VLA v Weybridgu potrjujejo tudi sum ptičje gripe pri poginulih labodih iz Slovenije.

(Sveža vest: pravkar je RTV Lj. sporočila, da je pri preiskanem "slovenskem" labodu bil ugotovljen visokopatogeni virus aviarne influence H5N1; v oddaji Trenja na PopTV pa so povedali, da je mogoče na spletni strani Kliničnega Centra v Ljubljani najti nekaj pomembnih informacij o ravnanju javnosti v pogojih ogroženosti zaradi aviarne influence: >1, >2, >3, !)

Spolno v. nespolno...

Na spletni strani McMaster University, med novicami, lahko preberete zanimivo predstavitev spolnega razmnoževanja pri glivah: tudi o prednostih in slabostih te evolucijske prilagoditve…

Še o ptičji gripi

Sprotno, na trenutke zelo dramatično, spremlja problematiko infektivnih bolezni, zlasti ko v zadnjem času več govori o ptičji gripi, avtor bloga Dottore Pesta.    

Intervju o bioterorizmu

Na blogu znane ameriške Mayo klinike boste našli poučen intervju s Franklinom Cockerillom III, zdravnikom mikrobiologom in infektologom o bioloških bojnih sredstvih in bioterorizmu.

Nova revija in novo ocenjevanje

Založnik odprtega dostopa BioMed Central je pričel izdajati novo revijo Biology Direct. V uredniškem prispevku E. V. Koonin in sod. najavljajo revijo, ki bo objavljala različne znanstvene žanre, od kratkih prispevkov, originalnih raziskovalnih člankov, hipotez do revijalnih pregledov iz celotnega spektra biologije. Posebnost pa predstavlja odločitev založnika, da bo revija odprta še na nek drug način. Prispevki bodo namreč presojani s t. i. odprtim ocenjevanjem z vrstniki (»peer review«) in ocene bodo z imeni ocenjevalcev objavljene skupaj s članki. Uredniki obljubljajo, da bodo objavili tudi članke npr. s tremi negativnimi ocenami, če bodo presodili o smiselnosti takega koraka in če se bo avtor strinjal, da objavijo delo pod takimi pogoji.

Z matematiko podprta epidemiologija

Mešani raziskovalni skupini Harvard Medical School in Harvard Pilgrim Health Care je ena od agencij NIH odobrila zajetno projektno nalogo za razvoj zmogljivih matematičnih in statističnih modelnih tehnik za odkrivanje in spremljanje izbruhov infekcijskih bolezni, ki se bodisi pojavijo naravno ali kot posledica namernega bioterorističnega napada.